病毒爆发第31天，末日的阴影愈发浓重地笼罩着世界。落枫镇污水处理厂，这个曾经默默运转的地方，如今成为了生死存亡的关键之地。
仅存的净水设备被黑石商队牢牢控制，宛如扼住了众人咽喉。丧尸尸体肆意污染着地下水系，散发着令人作呕的腐臭，要想净化水源，氯气成了急需之物。而雨季即将来临，水库的水一旦被丧尸污染，后果不堪设想，一场水库争夺战在所难免。
陈默，凭借着对外卖路线的深刻记忆，在镇郊找到了二战时期的防空洞暗河，为大家带来了一丝生机。林晓冉则在绝望中发现，孕妇的尿液竟能延缓净水设备的腐蚀，暂时缓解了设备随时可能报废的危机。然而，就在局势稍有缓和时，老吴却被揭发曾参与水厂贪腐，管道图纸造假的伏笔在此刻被揭开，他的行为曾间接导致污水处理厂的一些隐患，让众人对他的信任瞬间崩塌。
与此同时，另一处的危机也在悄然降临。孕妇出现了早期感染症状，情况危急。剖腹产手术迫在眉睫，可现实却困难重重。柴油发电机是维持无影灯的关键，然而柴油储备本就稀少。唯一能充当麻醉剂的，只有自酿的高度白酒，其效果与安全性都难以保证。更糟糕的是，胎盘早剥使得孕妇大出血的风险高达87%。
产房外，护士派和生存派陷入了激烈对峙。护士派主张全力救助孕妇和孩子，认为这是医者的职责；而生存派则觉得在资源极度匮乏的情况下，这样做太过冒险，可能会搭上更多人的性命。周小葵心急如焚，为了帮助孕妇，她冒险偷取黑市抗生素，却意外引发了感染，让局势更加危急。终于，新生儿呱呱坠地，那第一声啼哭却如同一道催命符，引来了丧尸群，声波吸引机制得到了证实。众人不得不一边应对丧尸的攻击，一边照顾刚刚生产的孕妇和脆弱的新生儿。
在混乱之中，更大的阴谋被揭露。所谓带有“三环标志”的疫苗，不过是葡萄糖溶液，这是银盾卫队控制幸存者的手段。他们用这种假疫苗，让幸存者误以为自己得到了保护，从而对银盾卫队言听计从。而老吴，他电工包暗格藏有原始病毒株，坐实了他曾是实验室安保员的身份，这也解释了他为何知晓一些不为人知的秘密。
面对这一连串的危机，众人没有放弃，而是努力寻求生存之道。他们用高压锅改造简易离心机，试图分离血清，寻找对抗病毒的方法。在不断尝试中，发现o型血对病毒有天然抗性，虽然误差率在±12%，但这无疑是一个重要发现。同时，高温天气使丧尸腐烂速度加快，其存活周期修正为5周，这一信息也让众人对丧尸的行动规律有了新的认识。
为了在这末日中生存下去，一个新的社会组织——道路公社，在国道服务区建立起来。他们以货车围栏构建移动防御工事，恢复了以物易物的体系，1支胰岛素可以换取10升柴油，在这个资源匮乏的世界里，建立起了一种新的交易规则。
然而，新秩序下也隐藏着权力斗争。陈默团队遭遇了道德绑架，公社成员强迫他们分享医疗资源，全然不顾他们自身也面临着巨大的生存压力。公社私自处决疑似感染者的“净化仪式”，更是让陈默等人感到心寒。周小葵运用化学知识，揭穿了公社所谓“圣水”的骗局，原来不过是次氯酸钠稀释液，根本无法起到神奇的净化作用。
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